Co je to peptidová sekvence?
Peptidy jsou biologické polymery tvořené spojením aminokyselin, jejichž klíčové prvky jsou uhlík (C), vodík (H), kyslík (O) a dusík (N).Termín peptidová sekvence se týká pořadí, ve kterém jsou spojeny aminokyseliny.Peptidy jsou v živých systémech velmi důležité a kombinují se vytvářejí mnohem větší řetězy zvané proteiny.Ačkoli existuje mnoho odrůd biologických peptidů, většina z nich je tvořena pouhými 20 aminokyselinami.Proteiny provádějí řadu biologických funkcí, včetně enzymů a ve struktuře buněčných stěn v rostlinách a membránách v živočišných buňkách.
Aminokyseliny se nazývají, protože mají amin (-NH 2 ) a kyselinu karboxylovou (-co (-co (-co 2 H) Skupiny.Většina aminokyselin nalezených v biologických systémech má obecný vzorec R-CH (NH 2 ) -co 2 H, kde r je řada skupin.Měnící se struktura R je to, co ovlivňuje strukturu a vlastnosti peptidů a proteinů.Výsledkem je tvorba amidové skupiny struktury -n (H) -co-, kde se vazba na uhlík na uhlík nazývá peptidová vazba.Reakce může dojít k množství peptidové sekvence různých funkčních skupin, z nichž každá je rozptýlena amidovou skupinou.
peptidy a proteiny mají různé úrovně struktury.Primární proteinová struktura je pořadí, ve kterém jsou nalezeny aminokyseliny;Toto je jeho peptidová sekvence.Funkční skupiny na proteinu spolu navzájem interagují, aby je vytáhly do tvaru.Jednotlivé zvraty a zatáčky peptidu se nazývají jeho sekundární struktura.Jeho celkový tvar, čistý výsledek všech těchto zvratů a zatáček, je terciární struktura peptidů. Biochemické vlastnosti proteinů nebo peptidů závisí na terciární struktuře.Stejně jako u všech chemikálií budou proteiny předpokládat nejospravedlnější tvar.Tento tvar je způsoben atraktivními a odpudivými silami mezi skupinami na jednotlivých aminokyselinách.Proto je terciární struktura způsobena primární strukturou, což znamená, že dedukce peptidové sekvence konkrétního proteinu nakonec vysvětlí jeho vlastnosti.Mnoho biologických procesů závisí na působení proteinů a léky často fungují tím, že kopírují nebo blokují působení těchto proteinů.Pochopení chování proteinů by mohlo vést k návrhu účinnějších léků.Z tohoto důvodu má oddělení výzkumu a vývoje farmaceutické společnosti obvykle peptidovou knihovnu nebo peptidový katalog, který bude používat při hledání nových léků.